Коллекции «Фотографии» и «Негативы» Ярославского музея-заповедника насчитывают более тридцати одной тысячи единиц хранения. Собрание включает дагерротипы, ферротипы, позитивы (фотографии), фотоальбомы и фотооткрытки. Позитивы составляют большую часть коллекции. Коллекция негативов представлена негативами на стекле и пленке. Фотоматериалы датируются серединой XIX века до начало XXI века.
Основа для создания фонда фотографий и негативов была заложена членами Ярославской губернской ученой архивной комиссии (ЯГУАК). Сборы фотоматериалов ЯГУАК и созданного при ЯГУАК музея — Древлехранилища легли в основу коллекций «Фотографии» и «Негативы» Ярославского музея-заповедника. Первые поступления фотоматериалов в ЯГУАК датируются серединой 1890-х гг., в массе своей они поступали за счет даров. Следует отметить имена таких сдатчиков как И. А. Тихомиров, И. Ф. Барщевский, Н. Д. Микерин, А. Н. Никанорова, П. И. Иваницкий, И. А. Лазарев, А. В. Работнов, И. А. Шляков, П. П. Покрышкин, П. В. Мосягин, А. А. Никифоров и др.
В дальнейшем комплектование коллекций происходило за счет даров или закупки от частных лиц, коллекционеров или предприятий, материалов историко-бытовых экспедиций.
Одними из наиболее ценных экспонатов коллекций являются дагерротипы и ферротипы — первые образцы светописи. Большой интерес представляет портретная и видовая фотография конца XIX — начала XX века. Представлены работы, выполненные как ярославскими фотографами (А. Свейковским, П. И. Иваницким, Г. А. Петражицким, А. Н. Никаноровой, И. А. Лазаревым, В. А. Лопатиным, И. Ф. Барщевским и др.), так и мастерами городов и сел Ярославской губернии, ряда других городов России и зарубежных стран.
По дореволюционному периоду собраны материалы о революции 1905 года, русско-японской и Первой мировой войнам. Следует отметить фотографии и негативы, связанные с промышленностью Ярославского края. В ходе историко-бытовых экспедиций были собраны снимки по истории ряда промыслов Ярославской губернии.
Среди фотографий периода революции и гражданской войны следует выделить материалы по белогвардейскому восстанию 1918 года в Ярославле. В коллекции представлены снимки, зафиксировавшие разрушенные дома, храмы, улицы города, разборку завалов, людей, оставшихся без крова.
После революции широкую популярность получает групповой портрет. В собрании музея представлены фотографии участников партийных конференций, съездов, совещаний, работников фабрик, заводов, колхозов, героев Великой Отечественной войны, деятелей науки, искусства, преподавателей и учащихся школ и вузов и др.
Фотографии и негативы, посвященные общественно-политической жизни Ярославского края, включают материалы по партийным конференциям, съездам, пленумам, профсоюзам, демонстрациям, по истории комсомола и пионерской организации, общественным движениям рубежа 1980-х — 1990-х годов. Представлены фотографии и негативы по промышленному строительству, развитию сельского хозяйства, транспорта, здравоохранения, образования, спорта, науки в Ярославском крае.
Великая Отечественная война отражена в портретах ярославцев — участников сражений, тружеников тыла, в изображениях 234 Ярославской коммунистической дивизии, 243, 246, 288 стрелковых дивизий. Собраны снимки зданий, разрушенных немецкой авиацией, материалы по строительству оборонительных сооружений.
Особое место занимают фотографии и негативы уроженцев Ярославского края, а так же тех, кто был в той или иной степени связан с Ярославской областью. Наиболее полно представлены фотографии и негативы наших знаменитых земляков В. В. Терешковой — первой в мире женщины-космонавта и материалы Л. В. Собинова — великого русского оперного певца. Коллекция Л. В. Собинова составляет более полутора тысяч фотографий и фотооткрыток. В собрании представлены портреты, сценические образы артиста, фотографии семьи, друзей и партнеров певца. Особую ценность представляют снимки с автографами.